La Grotta Gigante può vantare importanti collaborazioni con istituzioni scientifiche di importanza internazionale, che conducono preziose ricerche nella cavità e sul suo comprensorio esterno.
Istituto Nazionale di Oceanografia e di Geofisica Sperimentale (INOGS)
• Stazione sismometrica
• Rilievo con tecnologia Laser Scanner
• Progetto Th.O.M.A.S.
Università degli Studi di Trieste
• Pendoli Geodetici (Dipartimento di Matematica e Geoscienze)
• Stazione di misurazione della dissoluzione carsica (Dipartimento di Matematica e Geoscienze)
• Monitoraggio della velocità di crescita delle stalagmiti (Dipartimento di Matematica e Geoscienze)
• Monitoraggio “Lampenflora“ (Dipartimento di Scienze della Vita)
• Monitoraggio polveri sospese (pollini e inquinanti) (Dipartimento di Scienze della Vita)
Istituto di Scienze Marine (CNR)
• Stazione Climatologica del Carso (in collaborazione con la Protezione Civile del FVG)
ARPAFVG
• Monitoraggio delle emissioni di Gas Radon
F.E.S.N.
• Stazione sismometrica
Museo Civico di Storia Naturale di Trieste
• Monitoraggio della fauna sotterranea
Soprintendenza archeologia, belle arti e paesaggio del Friuli Venezia Giulia
• Collezione ospitata nel Museo Scientifico Speleologico
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